Tiub silikon gred makanan secara amnya tidak disyorkan untuk bersentuhan langsung dengan pembasmi kuman. Walaupun tiub silikon boleh bertolak ansur dengan bahan kimia tertentu dalam beberapa kes, pembasmi kuman selalunya mengandungi oksidan kuat, klorida, alkohol, atau komponen kimia menghakis dan reaktif lain yang mungkin bertindak balas dengan gel silikon, menyebabkan kakisan permukaan, pengerasan, perubahan warna atau kemerosotan prestasi tiub silikon.
Sebagai contoh, walaupun tindak balas antara natrium hidroksida dan gel silikon agak ringan pada suhu bilik, ia mungkin mengalami tindak balas yang ganas pada suhu tinggi, menjejaskan prestasi tiub silikon. Begitu juga, bahan pembasmi kuman yang mengandungi klorin seperti natrium hipoklorit mempunyai sifat pengoksidaan yang kuat dan boleh merosakkan struktur kimia gel silika. Walaupun pembasmi kuman alkohol kurang merengsakan, pendedahan jangka panjang juga mungkin mempunyai kesan buruk pada gel silikon.
